员工出错罚款1000不合法。首先，罚款属于行政处罚手段之一，而公司不属于行政机关，所以不能对员工罚款。其次，员工工作时出现过错，公司想要处罚员工的，可以采取以下办法：
1、在劳动合同中约定员工未完成劳动定额或承包任务，公司可以发放最低工资；
2、在员工手册、规章制度中明确违纪处罚规定，并经公司员工同意。
虽然按规定公司没有罚款的权利，但是可以在员工手册或是规章制度中规定，一旦员工出现违纪情况，可以向员工说明违纪及处罚情况。不过，这些处罚规定必须向员工们公示，并经员工同意，否则对员工无效；
3、以奖代惩，跟员工约定奖金的获得规则，比如“全勤奖”。
最后，若是公司对犯有过错的员工任意罚款，即未按以上形式，未在劳动合同中约定罚款，或者制定员工手册、公司规章不合法，那么员工被罚款后，可以去申请劳动仲裁处理。法律依据：《中华人民共和国行政处罚法》
第八条
公民、法人或者其他组织因违法行为受到行政处罚，其违法行为对他人造成损害的，应当依法承担民事责任。违法行为构成犯罪，应当依法追究刑事责任的，不得以行政处罚代替刑事处罚。
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